关东军司令部所下辖机构，在它存在的20多年间也在不断变化。到1945年日帝国投降时，关东军司令部当时下设五部四课，即：参谋部、兵器部、经理部、医务部、兽医部。参谋部又下设四课，分别承担作战、情报、交通及对伪满政务等多项介入主宰等任务。关东军司令部也是直接策划和指挥9.18事变，（屠）杀和镇（压）中国百姓的总区枢和黑色刽子手。
1931年9月18日，日关东军特别守备队在关东军司令部的密谋、策划和指挥下，秘密动用柳条湖所，精通〔爆〕破技术的河本末守，继黄姑屯后又一次采用〔爆〕破技术，炸毁沈阳郊外柳条湖段一公里多南满铁路。然后嫁祸给中国东北边防军驻老营奉天守军独7旅，并以此为借口喙头，动用早已以秋季拉炼为名，沿南满铁路18城镇部署到位的日关东军铁路守备队6个大队，及以换防休整之名进入满洲地区的第2师团，这台战争机器，全面发动了进攻东北军北大营，攻占沈阳及沿南满铁路18城镇的〔侵〕战争，翌日又开门揖盗的洽熙策应下占领长春。
9．18事变的爆发，使辽境一夜之间全境沦陷，百姓陷入了苦难深重深渊。为了维护其法（西）斯殖民（统）治，镇（压）中国百姓的抗争，关东军又对东北全境百姓、抗日义勇军、抗联等力量实行了残酷的军事（镇）压，捏制了无数起血案惨案来（屠）杀的中国百姓不计其数。
尤其是后交给关东军司令部指挥下辖的关东军宪兵司令部下的宪兵队，在有剃头刀之称的东条英机指挥下，更是（血）腥（屠）杀、镇（压）中国百姓的急先锋。用三年时间剿尽和扑灭了东北义勇军和抗联，镇〔压〕了全境土匪，没被剿的也全迫其写下了安分降书根本不敢与其为敌。在东北沦陷的14年间，日伪军、警（屠）杀和镇（压）中国百姓的所有（暴）行，全面发动〔侵〕华战争均是在它关东军司令部直接指挥下进行的。
关东军司令部下辖直属的另外两个杀人嗜血魔窟，一个是设在哈尔滨的731部队，一个是设在长春的100部队。他们专门从事着毒人害人及活人的标本〔解〕剖及置畜细菌研究。这两个神秘而残酷的血盆大口，到底杀害和吞噬了多少中国人的生命谁也说不清楚。
1949年春，原关东军司令部直属100部队，驻地附近的农民在开恳挖土时，就挖出过大（量）人骨和整尸，当时现场堪察取证时挖到6尺至1丈深时，均还有人的尸体尸骨岀土。
日关东军司令部，当时是日〔本〕帝国在东北实行殖民（统）治的最高权力机构，也是伪满洲国的太上皇。9．18事变成功后，日帝国早以策划和一手操纵的所谓独（立）国家伪满洲国。即定都于长春，并将长春更名新京。可算是日关东军司令部成功策划和实施了其所谓最高机密“新京”计划，在中国的国土上巩固了9.18事变成果，辅垫了全面发动〔侵〕华基础，争取到了发动全面〔侵〕华的战争准备时间。
1932年3月10日，溥仪被宪兵情报课秘密转致长春，出任伪满洲国皇上，执政的第二天就与关东军司令官本庄繁签订的密约中就签定了伪满洲国的国防和治安全权委诸日关东军管理协定，并所需经费由伪满洲国全额负担。而伪滿洲当局及地方各署则必须任用日人，而其人物之选定必须征得关东军司令官的同意的〔卖〕国〔卖〕主权〔卖〕人格协议。让一场主权侵的战争变成了合理合法的代〔理〕战争，让一场又一场的血腥〔屠〕杀变成了受委托平判平乱的“合理”执法的军事行动。
1933年8月，日内阁又炮制了《满洲国指导方针要纲》，决定了对满洲国的指导在现行的体制下，可耻的颁布由关东军司令官兼任日帝国驻满洲大使的内部统辖下，而主要由日籍官吏实际进行管理治理。
伪满洲国建国之后，在行政上实行是由关东军下辖的总务厅中心制和次长制而实施和开展政务治理。即在伪满国（务）院和各省、地政务中其行政工作均由总务厅、总务司实际上主持。而这些总务厅、总务司的官长则均由关东军司令部下辖的参谋部来指定日〔本〕人担任，并且由伪满国（务）院下文至各部、省、县、旗等政务中设次长。
次长也均一律由日〔本〕人担任，代表日方来主理政务，代表日关东军军方的利益来发号施令！也只对日关东军司令部负责。不但如此，而且为了能完全而充分的控制伪满皇帝溥仪，关东军司令部还对伪满皇上溥仪也采取了特别措施。即在溥仪身边专设一名关东军常住代表，被称为帝室御用。挂的当然也是日关东军少将军人，负责全面控制和监督溥仪的一切言行。由此可以看出关东军司令部才是名副其实的伪满洲国的太上皇。
在1931年至1945年的14年间，日国先后任命了7任关东军司令官，但不论是本庄繁、武藤信义、菱刈隆、南次郎、还是植田谦吉、梅津美治郎、山田乙三均还是抗不住中国延安发起的全民抗战活动，挽救不了关东军在中国大覆灭投降的厄运。
1945年，日寇开始在战场上节节败退。8月11日，关东军司令部开始准备后事。司令部院内开始燃起了焚烧文件档案的大火，也开始传岀一片片，一阵阵鬼哭狼嚎之声。
日国内〔天〕皇宣布战败投降后，70万现役关东军成了苏联红军的俘虏。司令官山田乙三向苏联红军投降，被远东军事法庭审判，判处最高刑期25年的下场。日关东军司令部历任关东军司令官：
立花小一郎，中级将。1919年－1921年。
河盒操，中级将。1921年－1922年。
尾野実信，中级将。1922年－1923年。
白川义则，中级将。1923年－1926年。
武藤信义，上〔将〕。1926年－1927年。
村冈长太郎，中级将。1927年－1929年。皇姑屯事件的最高决策者。
畑英太郎，中级将。1929年－1930年。
菱刈隆，中级将。1930年－1931年。
本庄繁，中级将。1931年－1932年。9．18事变最高栺挥者。
武藤信义，上〔将〕。1932年－1933年。日承认满洲国的最高策划者。
菱刈隆，上〔将〕。1933年－1934年。满洲帝国成立的成立掌权者。
南次郎，上〔将〕。1934年－1936年。
植田谦吉，上〔将〕。1936年－1939年。七七事变最高指挥者并全面发动〔侵〕华战争。。
梅津美治郎，上〔将〕。1939年－1944年。关东军升格为关东军总军
山田乙三，上〔将〕。1944年－1945年。日投降时任总司令官，后被苏联红军押到伯力接受审判。
旅顺火车站，熙熙壤壤的出站口寒梅、剑南跟在陆涛身后岀了站口。
兰香丫头却跟在副官及其它四人身后也检票岀了站。
岀站后，陆涛上了一辆黄包车。而跟在身后的寒梅、光宏也亲密地挽着来到另一辆黄包车边，上了另一辆黄包车跟在陆涛身后。
副官一行五人却不散也不近，若近又若离的在前面而行。兰香丫头则不紧不慢的跟在他们身后，致到副官一行五人进了一家客栈。她就等候在外面，直到副官定好房，在门口给她用手式发岀了房号后她才离开。
而跟在陆涛身后的寒梅、光宏二人也是跟着陆涛到了一家大型客栈下车，直到开好了房的陆涛岀来，向她二人用手式告知房号后，二人才上了另一辆黄包车离开。一场空前的冒险行动，一行三路人因各自的身份不同，亙信不足也不能坚定亙信以命相托的情况下终于顺利的奉天抵达旅顺，以寒梅、光宏二人指挥中心各自安顿了下来。
另一家预先约定的饭店门口，寒梅、光宏几乎与兰香丫头先后到达。从黄包车上下的寒梅，亲蜜地挽着光宏向她伸过来的手臂，后面跟着兰香丫头。一行三人来到吧台定好房间，拿了钥匙后，经宽敞的楼梯上楼，经鲜红的地毯来到房间门口，打开房间进到房内。兰香丫头放下手提箱，三人分别把房间检查一遍后回到客厅寒梅说；“从现在起，你们俩要尽量少说话。这里满是川岛芳子的青年军和护国军的便衣暗探，当心暴露了身份。”
光宏对兰香丫头道；“他们五个安顿下来了吗？”
兰香丫头说；“他们五个很安全，全都住下了。”
寒梅也不无担心的对兰香丫头说；“行动接迎时你可得机灵点，狼口夺崽，虎口争肉也要斩断军方高层呼图这条线，来打击川岛芳子在军方的力量，重新撑握部队，震慑企图满清复国的地政官吏。现在咱们一块去接头取货，然后按计划分头行动。我们只有一次行动机遇，没有第二次再来的机会。”