清晨，亚西亚岛，神殿。
在这里，聚集了亚西亚岛的高层干部，有族长、部落酋长、祭祀……在他们的面前是一个少年，在少年的旁边还有一个女孩和一个老奶奶。
族长看着少年说道：“你就是毁灭者？果真是一表人才啊！你是来看预言者给你留的话把，来人，把石板拿上来。”
说着，一个人捧着一块石板上，那个人把石板递给了小海，小海看着石板上有三个大字“和为贵”。他不知道，这三个字影响了他一生。
小海又看了看石板，然后疑惑的问族长：“这是什么意思？”
族长无奈的摇了摇头说道：“我们也不知道是什么意思。”
突然，原本晴空万里的天空，变得乌云笼罩，雷声大作……
……
几小时前，在亚西亚岛附近的海域上，一道红光，一道黄光，一道蓝光闪过天际。仔细一看，是三只精灵。
红光是一只红色的大鸟，它拥有着黄色的身躯，可身上燃烧着火焰，正是传说火系神奇宝贝——火焰鸟。
黄光是一只黄色的大鸟，它全身的毛如同尖针一般，时不时的还会闪过几道电流，便是传说电系神奇宝贝——闪电鸟。
蓝光是一只蓝色的大鸟，它的蓝色的身躯如冰山美人一般有着圣洁的气质和妖娆的身姿，它就是传说冰系神奇宝贝——急冻鸟。
三鸟在世界各地旅行，就在今天，它们旅行到了橘子群岛，它们觉得橘子群岛的环境很好，想在这里安家，正在找适合它们的小岛。
当它们飞过亚西亚岛附近的海域时，看到亚西亚岛附近的三座小岛很适合它们。
火焰鸟飞到其中一座小岛上，“嗷~”火焰鸟在岛的上空叫着，像远古的召唤一般。
突然，地面凸起，地面凸到有一座小山高时，小山的山洞裂开……
“轰”
一座火山喷发了，岩浆从山上流下，流进海里……
闪电鸟挑了一座石头比较多的小岛，闪电鸟飞到小岛上空，“嗷~”仰天长啸。
小岛被乌云笼罩，从乌云中电射出雷电，雷电打击在小岛上，小岛上石头之头之间时不时的穿过一道电光……
急冻鸟的小岛有一座高山，急冻鸟在岛上盘旋着。
小岛上刮起了一阵寒风，寒风所过之处都披上了一层寒霜，海水也被冻结……
深海，一双眼睛猛的睁开……
三鸟正在建造着各自的家，突然，大海呼啸，一根水柱冲天而起，在水柱的尽头一声咆哮，一只白色的大鸟破水而出，白色的身躯，背上还有两排小翅膀，这正是传说神奇宝贝——洛奇亚。
三鸟在这里建造影响到了洛奇亚，所以现在洛奇亚很愤怒，整个橘子群岛都被乌云笼罩着，雷雨交加，狂风大作，大战，一触即发……
……
神殿前，小海望着远方说道：“我去看看。”说完，小海就飞走了，对，就是飞，这是小海下意识做的，他觉得这就像是走路一样。在神殿前的众人全部像石化了一样，族长半天才反应过来说道：“毁灭者就是不一样啊！”众人没发现，在小海走了后还少了一个人……
飞得越来越近了，小海终于看清楚是什么情况了，原来是火焰鸟、闪电鸟、急冻鸟和洛奇亚在打架。原本三鸟并不想和洛奇亚打，可是洛奇亚现在和愤怒，所以见鸟就攻击，三鸟也被惹火了！这种情况有两种解法，一是有绝对的实力打赢它们，二是平息它们的愤怒。
因为急冻鸟的关系，现在海面结冰了，小海降落在冰面上，从背包里拿出所有精灵球，全部丢出去，小火龙、闪电鸟、腕力、可达鸭，小海看着眼前的阵容不禁皱起了眉头，自己有两个可以打的，而对方有四个，这怎么打？腕力不可以飞，可达鸭太弱，等等，为什么说是两个呢？小火龙也不会飞啊。小海叹了口气，算了，豁出去了。
“闪电鸟，十万伏特，你先去托住洛奇亚，尽量躲避攻击；熔林，进化，影分身。”小海指挥着精灵，指挥完精灵小海就觉得怪怪的，熔林是什么？是这只小火龙的名字吗？进化？什么乱七八糟的？算了。
闪电鸟对正在和三鸟对抗的洛奇亚使出十万伏特，因为洛奇亚一是处于愤怒状态，二是三鸟分散了它的注意，所以，闪电鸟一击命中了洛奇亚，洛奇亚堕落到了海里。
而熔林进化成喷火龙，趁闪电鸟把洛奇亚击落，用出影分身，分身出上百个熔林，所有熔林把三鸟围住。
小海见此时机，阴差阳错的喊了一句：“时间咆哮。”时间咆哮？这不是迪亚鲁卡的绝招吗？
熔林们在嘴前凝聚出了一个蓝色的能量球，但是，还没能量凝聚完，三鸟就分别使出了火焰喷射、十万伏特、急冻光线扫荡了一大片熔林，剩下的熔林等凝聚完能量已经是零零散散的了，发射时间咆哮，三鸟躲过了一些，但也被命中了一些，三鸟相继被击落，三鸟堕落到了冰面上。
小海松了一口气，这时，一个声音响起：“小海哥哥赢了！耶！小海哥哥赢了！”
小海转过头看到了娜儿，露出了微笑，突然，小海想到了什么喊到：“娜儿，快跑……”
还没等小海把话说完，一道破坏死光突破冰层，打中了娜儿，娜儿在破坏死光的照耀下消失……洛奇亚也从冰层中飞了出来。
小海低着头楠楠的说道：“为什么……她不是个无辜的女孩……为什么……”小海想到了那天夜晚在草地上他答应过她的话：
“小海哥哥，你喜欢娜儿吗？”
“喜欢。”
“那小海哥哥会保护娜儿吧……”
“哥哥会保护娜儿的。”
小海还记得，明明答应过她会保护他的，可是，现在……
三鸟和洛奇亚看到这都很内疚。熔林和闪电鸟也没有继续攻击。
突然，小海抬起头，他原本黑色的眼精呈现出灰色，仿佛魔神降世一般……
超能力者和超能力神奇宝贝有一种暴走状态，在暴走状态下，超能力会成倍增长，而现在，小海不紧处于暴走状态，他还暂时性突破了所有封印，代价是事后小海会有一段虚弱期。
“啊！”
小海咆哮了一声，犹如地狱咆哮，小海的力量终于暴发出来了，一根紫色的能量柱破九天而起，能量柱透着深深的毁灭气息，毁灭一切，能量柱不停的扩大，三鸟、洛奇亚、熔林被笼罩在里面……
一场毁灭席卷了这片天地……当这场呼啸过去，一切尘埃落定，在冰面上，小海静静的躺在那，在他不远处还有三鸟和洛奇亚也躺在那，而熔林毫发无伤的在那飞这，就在毁灭快要降临在熔林身上时，它使出了瞬间移动，躲过了这场浩劫……
……
阿桂，欣悦，熔林，阿冰……这些在记忆在小海的脑前闪过，不，他现在已经变回阿桂了，当他看到娜儿消失……
清晨，在一个茅草屋里，一个少年从梦中惊醒：“不……娜儿……”
这时，一个声音响起：“小海哥哥，我在哦！”
阿桂看着娜儿：“娜儿！”
原本，在破坏死光突破冰层时，娜儿脚下滑了一下，退后了几步，没给破坏死光打中，因为破坏死光把周围的冰层震出了裂缝，娜儿脚下的冰层塌陷让她掉到了水里，这也让她躲过了后来阿桂的暴发。
至于三鸟和洛奇亚，当时它们被阿桂的暴发打的只剩下了一口气，岛上的祭祀用一种古老的魔法，把三鸟的本原存到了三个球里，只要这三个球还在三鸟就不会死，而洛奇亚的本原存在一个乐器里，岛上的居民还给三个球修了一个神社存放，而那个乐器则被族中存放……
……
夜晚，阿桂和娜儿座在草地上。阿桂对娜儿说道：“娜儿，我想起来我是谁了！我的名字叫，阿桂。”
“太好了！阿桂哥哥。你会离开吗？”娜儿先是高兴的说道，但是，又担心自己的小海哥哥离她而去。
阿桂想了想，他是一定会走的，因为他跟本就不属于这个时代，不过，他说道：“我不会离开你的。”
……
次日清晨，岛还是那座岛，人确不一样了，少了一个人，而且还少了一些记忆，还少了一块石板，没有谁还会记得那个少年，也没有谁还会记得那个少年的名字，包括娜儿，仿佛一切就像没发生一样……
在橘子群岛的一个海域上，一只喷火龙飞着，在它的背上站着一个少年，少年看着天空说道：“再见了，娜儿，再见奶奶，再见，亚西亚岛。也许，我只是一个过客罢了。”
说完，他坚定看着前方说道：“目的地，关东。”