当然关于SEELE，新旧版本的福音战士世界是有区别的，最直观的就是数量不同，旧版中有共计12名，并且是有真实肉体存在的，即是说背后是个人，而在新剧场版中，黑色石碑影像的背后并非是活生生的正常人。
不过不论是新旧版本，SEELE的目的应该都是类似的，即是所谓的“人类补完计划。”
而这个计划的第一步，就是首先要消灭掉所有来袭的使徒。
毕竟这些号称得到了生命之果的准完美生命，存在的意义是毁灭吃了智慧之果的人类，所以人类不论想要实现什么计划，使徒都是必然的敌人。
“第四使徒来袭与其被歼灭……”
“还有第三适格者的接收和初号机的启动……”
“大致按照既定之数进行着……”
“虽然初号机的初战并不顺利，以及零号机的巨大损伤也不在预计之内。”
“即使多少有些不完美，但是只要知道第五使徒出现的时候能够使用就行了。”
几个黑色“石碑”陆续传出声音。
“这方面不用担心，除了基本完好的初号机之外，二号机及其附属驾驶员已经在德国进行实证测评试验，三号机以及后续机型的建造也在按计划进行之中。”碇源渡撑着下巴的姿势一点未变，平静的回复道。
“合理利用NERV和EVA是你的责任，希望你不要让我们失望。”
“的确，毕竟消灭使徒只不过是与莉莉丝契约的一小部分，人类补完计划才是我们的最终目的。”（关于契约的部分，显然是新剧场版的新剧情，因为还未最终结局，因此细节未知。）
“现在问题在于未知力量的介入，我等在文书中并未得到任何相关的信息，显然不在计划之内。”
“难道是来自于别的地方，比如我等世界之外。”
“来自于宇宙吗？与莉莉丝类似之物？”
“显然并没有如此可怕的力量，不必危言耸听。”
“确实，不过既然不在计划之内，就要彻底排除，人类补完计划不容丝毫误差。”
“赞成。”
“赞成。”……
“知道了，一切都将按着SEELE的剧本进行。”
……
这些阴谋诡计暂且不提，让我们来看一下如今人类的主角正在做着什么。
实际上他什么都没做，就是穿着一身病号服望着窗外的夕阳在发呆。
原本接到父亲的召唤多少有些期待的心情早已经七零八落，使徒、EVA、可怕的怪物，残酷的战斗，这一切明明只发生在昨天，但是却又如此的让人感觉不真实。
整个医院空空荡荡，也不知道是因为这里是专门为碇真嗣这样的适格者服务，还是因为在第三新东京繁华的背后，实际上就是如此的空洞萧条。
少年惯有的沉默，却不是如同他父亲那样的城府阴沉，而是一种更加接近于发呆的自闭，前来接他离开医院的葛城美里看到的就是这么一个身影。
葛城来此的目的是带领碇真嗣回到基地听从进一步安排的，毕竟碇真嗣在之前一战中实际上也只是因为神经反馈而承受了一点痛苦，左手臂和右眼有些后遗症，却是身体对于神经反馈的过分反应，这基本上属于神经科的治疗范畴，并且只是一点小毛病而已，很快身体就会自动调整过来。
不过身体上的问题事小，碇真嗣那没有多少积极性的态度却更加让葛城担忧。
而当她带着碇真嗣面见了碇源渡，两父子的疏离以及让碇真嗣独自居住的安排让这种担忧达到了最高。
“没关系，还是一个人好，反正到了哪里都一样。”碇真嗣微笑着这么说，看起来极为平静，却让葛城下定了决心。
于是她决定让碇真嗣搬到她家里去住。
可喜可贺，这可是少年成长的第一步啊，与一个火辣御姐的同居，各种日常剧情的展开也让那个看起来永远沉默平静的少年各种hold不住。
另外一个关键，则是葛城带着碇真嗣来到了第三新东京市附近的山头，让碇真嗣第一次俯视整个城市，看着地下都市的功能建筑在阳光中升上地面，收集阳光和进行各种作业。
“这就是迎击使徒的专用要塞都市，第三新东京市，我们的城市。”
“也是你参与保护过的城市。”
这多少让少年那颗对世界充满疏离的心灵找到了一点真实感。
原来他的到来并非毫无意义。
也并非只是父亲这个因素而已。
当然身为碇源渡司令的儿子以及EVA驾驶员的身份很不一般，但是身为十四岁的少年，与同龄人的接触对于身心的健康成长是很有必要的，于是碇真嗣就这么被安排进入一个附近的学校就读。
这似乎也是日本漫画的一个重要元素，可惜在这个福音战士世界里毕竟还是有些不同，性格内向的碇真嗣对于学校的安排也仅限于听话而已，距离融入校园生活或许还有很长的一段路要走。
而狠狠挨了一顿揍这种事，或许反而让他对自己的校园生活有了一点真实感受。
至于EVA驾驶员该不该被普通人揍这种事，其实恰恰相反，正是因为他说出驾驶过EVA，然后就被打了。
原因似乎是因为在上一次使徒袭击事件中，打他的那个人的妹妹受了伤，现在还在医院里。
另外一件让他在意的事，则是那个曾经有过一面之缘的蓝发少女也在他的班上，看起来她身上的伤已经好多了，虽然右手还吊着绷带，但是起码能够来上学了不是吗。
只是这位少女最常做的事情就是定定望着窗外，或者独自一个人呆在某处不做任何事，她的身边似乎带着拒人于千里之外的光环，班上的同学不会主动与她交流，而碇真嗣更是从未听到她主动说过任何一个字。
当然除了这些小事之外，碇真嗣也终于开始接受正正经经的驾驶员训练了。
毕竟NERV不能指望初号机依靠觉醒来消灭所有敌人，EVA的维修费用可不便宜，零号机到现在还在修复当中呢，初号机的战斗力提升显然有利于减少战斗中的损失。